孙氏源于子姓。商朝末，纣王叔父比干，商之贤臣，因直谏而被杀，子孙避难改姓，其中一支以本为王族子孙之故，遂姓孙氏。

孙氏源于姬姓。公元前1055年，周公姬旦封康叔於卫（今河南淇县），建立卫国。春秋时，他的八世孙姬和因为攻灭西戎有功，被周平王赐为公爵，史称卫武公。卫武公有一个儿子名叫惠孙，惠孙的孙子名乙，字武仲，又叫武仲乙，把祖父惠孙的字作为姓氏，姓孙。因此武仲乙又称孙乙，他的后代就以孙为姓。

孙氏源于荀姓。汉朝时为了要避汉宣帝“询”音之讳，他下令荀姓子孙不得再姓荀，一律改为孙氏，并将战国时代的荀卿都改为孙卿。由是荀姓也成为孙姓支脉的一个源头。

孙氏源于赐姓。三国时期东吴将领俞河因功而被赐姓孙，因称孙河。孙河，本姓俞，年少时即随孙坚征讨沙场，孙坚视他作心腹。后又随孙策平定江东，多立战功，孙策赐姓予他为孙。