上杭的主要河流有汀江、旧县河、黄潭河。

1、汀江是福建省的四大河流之一，发源于宁化县境内牧马山北坡，经长汀县于回龙入境，由北向南纵贯全县。

2、旧县河为上杭第二大河，发源于连城县朋口毕华山南麓，经连城车头入县境内的南阳、旧县，在临城镇九州与汀江干流汇合。

3、黄潭河为上杭第三大河，发源于古田高寨山南麓和蛟洋大人岽，分别流至古田的苏家坡汇合，经吊钟岩入龙岩境，在桥下滩又折回上杭溪口、太拔、蓝溪、稔田，至永定池溪乡下河口与汀江干流汇合。